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現如今，是六月份，藍藻在6－9月容易大量繁殖。往往在大量藍藻死亡，腐敗時會大量消耗氧氣，釋放藻毒素，形成藍藻水華，造成水體大量缺氧，水質變異惡化，浮游生物減少，影響魚類正常生長，甚至會引起魚群中毒死亡，嚴重破壞水體環境的生態平衡，給水生動物造成很大危害。此時正是季節變換之時，溫度變化大，藍藻生長繁殖得快，因此要抓好藍藻防除工作。
常見的藻毒素的降解方法有如下幾種：微生物和生物酶降解；超生波去除；活性碳吸附；臭氧氧化。
但在常規的漁業生產中，我們可采取以下方法將之清除，更為實用：
潑硫酸銅法
當發現池水發紅時，此時多為多甲藻、裸甲藻由于溫度和PH值突然改變而大量死亡而產生甲藻毒素所致，這時用硫酸銅溶液全地潑灑，使水池藥物濃度為0.7毫升/升，2天后再換注新水，此種防除藻害方法效果比較好。
施生石灰法
害藻發生前經常更換新水，調節水質，保持其酸堿度，破壞其衍生環境，一旦發生后，用生石灰15千克/畝化漿全池潑灑，以提高池水的PH值，使這些藻類死亡，并注意及時換注新水和增氧。
灑草木灰法
選晴天上午，在魚塘上風頭拋灑草木灰，使其均勻地覆蓋在青苔上，一般施草木灰后3天有害藻類便死亡下沉，并注意及時換注新水和增氧。
豬糞清除法
當藻害不太嚴重時可用新鮮豬糞250-300千克/畝灑在海藻生長的地方，10天內便可將其殺死消除，并注意及時換注新水、調節PH值和增氧。
擺放松枝法
每隔2米擺放一棵碗口粗細的松枝尾梢，松針葉散發出的松節油芳香汁液可防止害藻生長，將其遏制消除。
還可使用一些水產生物藥劑來消除藻害，但要注意及時換注新水、調節PH值和增氧。
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